Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPP55072 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPP55072 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPP55072 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VCPP55072 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPP55072 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPP55072 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPP55072 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPP55072 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPP55072 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VCPP55072 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPP55072 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPP55072 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPP55072 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPP55072 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPP55072 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VCPP55072 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPP55072 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPP55072 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPP55072 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPP55072 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPP55072 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPP55072 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VCPP55072 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPP55072 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPP55072 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VCPP55072 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VCPP55072 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPP55072 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPP55072 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPP55072 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VCPP55072 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPP55072 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPP55072 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCPP55072 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPP55072 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPP55072 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPP55072 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCPP55072 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPP55072 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPP55072 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPP55072 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCPP55072 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCPP55072 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPP55072 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPP55072 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPP55072 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPP55072 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPP55072 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPP55072 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCPP55072 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCPP55072 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPP55072 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPP55072 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPP55072 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPP55072 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCPP55072 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPP55072 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPP55072 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPP55072 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCPP55072 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPP55072 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPP55072 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPP55072 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPP55072 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPP55072 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPP55072 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCPP55072 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPP55072 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPP55072 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPP55072 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPP55072 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPP55072 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPP55072 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCPP55072 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VCPP55072 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPP55072 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPP55072 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPP55072 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPP55072 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPP55072 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCPP55072 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPP55072 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPP55072 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPP55072 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCPP55072 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPP55072 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPP55072 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPP55072 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPP55072 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPP55072 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPP55072 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCPP55072 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms