Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PTK2-204ENST00000510126 580 ntTSL 414.88□□□□□ -0.034e-13■■■■■ 47.3
GTF2F1P35269 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.128e-12■■■■■ 47.3
GTF2F1P35269 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 412.91□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 FBXL19-209ENST00000566320 546 ntTSL 518.83■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.032e-11■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-11■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 CDC16-210ENST00000494766 1003 ntTSL 221.14■□□□□ 0.975e-17■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 CDC16-201ENST00000252457 2034 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.395e-17■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 CDC16-205ENST00000375308 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.395e-17■■■■■ 47.2
GTF2F1P35269 IDUA-202ENST00000502829 558 ntTSL 230.8■■■□□ 2.521e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.351e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.311e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.051e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.981e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 CMIP-205ENST00000564666 510 ntTSL 320.65■□□□□ 0.91e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 ITGA2B-209ENST00000592462 3189 ntTSL 519.81■□□□□ 0.761e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.671e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 GET4-206ENST00000464468 676 ntTSL 319.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.591e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 518.34■□□□□ 0.531e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 GBGT1-205ENST00000470431 2870 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 GBGT1-206ENST00000472281 2948 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 01e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.075e-10■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 PSAP-203ENST00000493143 576 ntTSL 213.85□□□□□ -0.191e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 EXOC4-202ENST00000393161 1604 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 EXOC4-219ENST00000486013 1600 ntTSL 510.59□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 EXOC4-205ENST00000462055 2364 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.841e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 ITGA2B-202ENST00000587295 496 ntTSL 39.07□□□□□ -0.961e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 PSAP-206ENST00000633965 500 ntTSL 58.52□□□□□ -1.051e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.051e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 EXOC4-220ENST00000486409 605 ntTSL 47.71□□□□□ -1.181e-11■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.282e-14■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.232e-14■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.152e-14■■■■■ 47.1
GTF2F1P35269 SLC2A9-213ENST00000513129 738 ntTSL 310.62□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 47
GTF2F1P35269 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 512.72□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 47
GTF2F1P35269 RBM33-209ENST00000440108 1027 ntTSL 519.69■□□□□ 0.746e-12■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 RBM33-210ENST00000486747 559 ntTSL 318.96■□□□□ 0.636e-12■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 RBM33-206ENST00000392761 2934 ntTSL 216.69■□□□□ 0.266e-12■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.296e-12■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 211.39□□□□□ -0.596e-12■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 PDXK-211ENST00000468392 1094 ntTSL 217.98■□□□□ 0.474e-13■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.122e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 LUC7L2-203ENST00000435096 570 ntTSL 320.34■□□□□ 0.852e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)20.04■□□□□ 0.82e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.632e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 416.33■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.012e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-10■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 GALNS-204ENST00000562831 609 ntTSL 327.6■■■□□ 2.012e-6■■■■■ 46.9
GTF2F1P35269 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 221.12■□□□□ 0.973e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.883e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.84■□□□□ 0.773e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 518.86■□□□□ 0.613e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 218.27■□□□□ 0.523e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.11■□□□□ 0.333e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.59■□□□□ 0.253e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 216.2■□□□□ 0.183e-14■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 321.35■■□□□ 1.013e-9■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 ACLY-209ENST00000590770 583 ntTSL 413.78□□□□□ -0.22e-11■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-11■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 ACLY-205ENST00000588547 471 ntTSL 310.97□□□□□ -0.652e-11■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 46.8
GTF2F1P35269 SSBP2-215ENST00000512098 566 ntTSL 515.26■□□□□ 0.033e-8■■■■■ 46.7
GTF2F1P35269 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 46.7
GTF2F1P35269 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 46.6
GTF2F1P35269 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-20■■■■■ 46.4
GTF2F1P35269 AC009120.2-203ENST00000565313 539 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-20■■■■■ 46.4
GTF2F1P35269 SLC4A2-206ENST00000466368 548 ntTSL 417.18■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 46.3
GTF2F1P35269 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 46.3
GTF2F1P35269 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 46.3
GTF2F1P35269 SMAD3-213ENST00000560175 542 ntTSL 414.56□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 46.3
GTF2F1P35269 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 411.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 46.3
GTF2F1P35269 SMAD3-212ENST00000559937 579 ntTSL 49.29□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 46.3
GTF2F1P35269 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 CALML4-202ENST00000395463 1445 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 CALML4-201ENST00000354678 611 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 AC107871.1-204ENST00000638026 2895 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 CALML4-204ENST00000448060 2520 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 CALML4-207ENST00000478113 3651 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 215.79■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-10■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 TAOK1-205ENST00000583121 526 ntTSL 310.07□□□□□ -0.83e-10■■■■■ 46.1
GTF2F1P35269 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 46.1
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 241.6 ms