Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB6AP20340 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6AP20340 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6AP20340 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms