Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB9P17482 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXB9P17482 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXB9P17482 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB9P17482 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms