Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KALRNO60229 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KALRNO60229 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KALRNO60229 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KALRNO60229 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KALRNO60229 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KALRNO60229 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KALRNO60229 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KALRNO60229 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KALRNO60229 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KALRNO60229 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KALRNO60229 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KALRNO60229 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KALRNO60229 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KALRNO60229 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KALRNO60229 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KALRNO60229 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KALRNO60229 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KALRNO60229 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KALRNO60229 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KALRNO60229 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KALRNO60229 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KALRNO60229 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KALRNO60229 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KALRNO60229 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KALRNO60229 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KALRNO60229 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KALRNO60229 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KALRNO60229 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KALRNO60229 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KALRNO60229 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KALRNO60229 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KALRNO60229 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KALRNO60229 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KALRNO60229 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KALRNO60229 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KALRNO60229 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KALRNO60229 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KALRNO60229 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KALRNO60229 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KALRNO60229 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KALRNO60229 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KALRNO60229 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KALRNO60229 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KALRNO60229 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KALRNO60229 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KALRNO60229 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KALRNO60229 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KALRNO60229 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KALRNO60229 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KALRNO60229 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KALRNO60229 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KALRNO60229 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KALRNO60229 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KALRNO60229 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KALRNO60229 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KALRNO60229 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KALRNO60229 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KALRNO60229 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KALRNO60229 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KALRNO60229 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KALRNO60229 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KALRNO60229 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KALRNO60229 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KALRNO60229 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 676 ms