Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BCKDKO14874 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDKO14874 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDKO14874 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms