Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms