Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAF4Q9BUZ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF4Q9BUZ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms