Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COG8Q96MW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COG8Q96MW5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COG8Q96MW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG8Q96MW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG8Q96MW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COG8Q96MW5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms