Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CREB3L1Q96BA8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREB3L1Q96BA8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L1Q96BA8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms