Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RYR3Q15413 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RYR3Q15413 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RYR3Q15413 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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