Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SHPRHQ149N8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SHPRHQ149N8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SHPRHQ149N8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SHPRHQ149N8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SHPRHQ149N8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHPRHQ149N8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
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