Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RAS1YOR101W 930 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 DAP1YPL170W 459 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 VMA11YPL234C 495 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 snR37snR37 386 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 PRP46YPL151C 1356 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 PCI8YIL071C 1335 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 SRM1YGL097W 1449 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 IMG2YCR071C 441 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 INH1YDL181W 258 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YDR455CYDR455C 309 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 PPE1YHR075C 1203 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 POC4YPL144W 447 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 ELP3YPL086C 1674 nt7.53□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 BNI5YNL166C 1347 nt7.52□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YDR132CYDR132C 1488 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 ENP1YBR247C 1452 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YDL026WYDL026W 312 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YDR042CYDR042C 603 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 MRPL25YGR076C 474 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 GCV3YAL044C 513 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 ORM2YLR350W 651 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 SET6YPL165C 1122 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 snR4snR4 186 nt7.52□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YER188WYER188W 720 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YLF2YHL014C 1218 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YHR112CYHR112C 1137 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 ORT1YOR130C 879 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 DCI1YOR180C 816 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 SNX3YOR357C 489 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 COX11YPL132W 903 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 SFL1YOR140W 2301 nt7.51□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 LAS17YOR181W 1902 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YEF1YEL041W 1488 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 THI6YPL214C 1623 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YFH7YFR007W 1062 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 SCL1YGL011C 759 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 ERG25YGR060W 930 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YAL066WYAL066W 309 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 ENT4YLL038C 744 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 PEX13YLR191W 1161 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 VMA6YLR447C 1038 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YNL190WYNL190W 615 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 MSC1YML128C 1542 nt7.5□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 TAH18YPR048W 1872 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 SSU1YPL092W 1377 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YDR401WYDR401W 564 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 KXD1YGL079W 657 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 RHO3YIL118W 696 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YJR084WYJR084W 1272 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 COQ2YNR041C 1119 nt7.49□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 URA4YLR420W 1095 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 SRT1YMR101C 1032 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 MDH2YOL126C 1134 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YOL150CYOL150C 312 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 SRL4YPL033C 846 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 LOA1YPR139C 903 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YSA1YBR111C 696 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 APM3YBR288C 1452 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 OSH7YHR001W 1314 nt7.48□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 DHH1YDL160C 1521 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 ATG32YIL146C 1590 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 TOM71YHR117W 1920 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 MTQ2YDR140W 666 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YGL177WYGL177W 348 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YLR402WYLR402W 192 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YBR027CYBR027C 333 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 TIP1YBR067C 633 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 YPR153WYPR153W 423 nt7.47□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 MET30YIL046W 1923 nt7.46□□□□□ -1.21
TY1A-DR3Q12441 KRR1YCL059C 951 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 PEX19YDL065C 1029 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YNG2YHR090C 849 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 TIF2YJL138C 1188 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 TIF1YKR059W 1188 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YMR187CYMR187C 1296 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 BSC5YNR069C 1470 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 PMT2YAL023C 2280 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ADE16YLR028C 1776 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 ADE17YMR120C 1779 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 SOL2YCR073W-A 948 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YCR100CYCR100C 951 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 CDC8YJR057W 651 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YKR051WYKR051W 1257 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 PAU7YAR020C 168 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YNR025CYNR025C 360 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 SAC7YDR389W 1965 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 TED1YIL039W 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 SPO16YHR153C 597 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YJL195CYJL195C 702 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 HAM1YJR069C 594 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 CBT1YKL208W 816 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 SPO20YMR017W 1194 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 RUF20RUF20 443 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 PFS2YNL317W 1398 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 PHO89YBR296C 1725 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 SNF4YGL115W 969 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 MRPL49YJL096W 486 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-DR3Q12441 YOR097CYOR097C 528 nt7.43□□□□□ -1.22
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