Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YBL070CYBL070C 321 nt6.15□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 SNT309YPR101W 528 nt6.15□□□□□ -1.42
VAM3Q12241 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.14□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 YGR139WYGR139W 339 nt6.14□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 YMR074CYMR074C 438 nt6.14□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 ARC35YNR035C 1029 nt6.14□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 PHO85YPL031C 918 nt6.14□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 NUP84YDL116W 2181 nt6.14□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 HXT15YDL245C 1704 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 HXT16YJR158W 1704 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 BRN1YBL097W 2265 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 SEC23YPR181C 2307 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 MEU1YLR017W 1014 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 YPR127WYPR127W 1038 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 HRB1YNL004W 1365 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 OSM1YJR051W 1506 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 VMA2YBR127C 1554 nt6.13□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 SKP1YDR328C 585 nt6.12□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 EFM1YHL039W 1758 nt6.12□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 CYB2YML054C 1776 nt6.12□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 EEB1YPL095C 1371 nt6.12□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 RPL43AYPR043W 279 nt6.12□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 MSI1YBR195C 1269 nt6.12□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 TFC6YDR362C 2019 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 NSE5YML023C 1671 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 MPA43YNL249C 1629 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 CYC8YBR112C 2901 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 TIF2YJL138C 1188 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 YJL213WYJL213W 996 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 TIF1YKR059W 1188 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 HST2YPL015C 1074 nt6.11□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 AMN1YBR158W 1650 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 PGI1YBR196C 1665 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 TDP1YBR223C 1635 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 CMR1YDL156W 1569 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 YFL052WYFL052W 1398 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 NPL6YMR091C 1308 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 YDR401WYDR401W 564 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 EDC2YER035W 438 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 NMA2YGR010W 1188 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 PIL1YGR086C 1020 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 NCA3YJL116C 1014 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 CCW12YLR110C 402 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 RQC1YDR333C 2172 nt6.1□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 PET117YER058W 324 nt6.09□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 YGL081WYGL081W 963 nt6.09□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 NTG1YAL015C 1200 nt6.09□□□□□ -1.43
VAM3Q12241 MKK1YOR231W 1527 nt6.09□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 HXT2YMR011W 1626 nt6.08□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 FZF1YGL254W 900 nt6.08□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 MIX17YMR002W 471 nt6.08□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 SWP1YMR149W 861 nt6.08□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 TAH11YJR046W 1815 nt6.08□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 TKL2YBR117C 2046 nt6.08□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 RSP5YER125W 2430 nt6.07□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 YLR358CYLR358C 564 nt6.07□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 SDH8YBR269C 417 nt6.07□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 ERG27YLR100W 1044 nt6.06□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 ENP1YBR247C 1452 nt6.06□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 OPT1YJL212C 2400 nt6.06□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 DLD1YDL174C 1764 nt6.06□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 ATF1YOR377W 1578 nt6.06□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 ERS1YCR075C 783 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 DOC1YGL240W 753 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 THR1YHR025W 1074 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 RPL2BYIL018W 765 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 KAE1YKR038C 1161 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 RRN10YBL025W 438 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 LDB19YOR322C 2457 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 CIT2YCR005C 1383 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 IRC5YFR038W 2562 nt6.05□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 GAA1YLR088W 1845 nt6.04□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 CLN1YMR199W 1641 nt6.04□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 HBN1YCL026C-B 582 nt6.04□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 HXK2YGL253W 1461 nt6.03□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 MRPL28YDR462W 444 nt6.03□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 RIX7YLL034C 2514 nt6.03□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 MSG5YNL053W 1470 nt6.02□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 YBR241CYBR241C 1467 nt6.02□□□□□ -1.44
VAM3Q12241 CEM1YER061C 1329 nt6.02□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 PAM17YKR065C 594 nt6.02□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 ATP23YNR020C 813 nt6.02□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 PZF1YPR186C 1290 nt6.02□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 GSH1YJL101C 2037 nt6.02□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 NOG2YNR053C 1461 nt6.02□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 CCT3YJL014W 1605 nt6.01□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 PIH1YHR034C 1035 nt6.01□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 DPM1YPR183W 804 nt6.01□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 POP1YNL221C 2628 nt6.01□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 YAL045CYAL045C 309 nt6□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 OPI11YPR044C 354 nt6□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 SMK1YPR054W 1167 nt6□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 GPH1YPR160W 2709 nt5.99□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 HXT17YNR072W 1695 nt5.99□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 HIS7YBR248C 1659 nt5.99□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 YHR145CYHR145C 357 nt5.99□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.99□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.99□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.99□□□□□ -1.45
VAM3Q12241 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 94.1 ms