Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 AAH1YNL141W 1044 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 RCL1YOL010W 1104 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 COQ8YGL119W 1506 nt8.33□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 HST4YDR191W 1113 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 CBS2YDR197W 1170 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 CAB1YDR531W 1104 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 GIM4YEL003W 336 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 NBP35YGL091C 987 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 SRP21YKL122C 504 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 SME1YOR159C 285 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YPR142CYPR142C 564 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 TEC1YBR083W 1461 nt8.32□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 TRS23YDR246W 660 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 RRT5YFR032C 870 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 MRPL25YGR076C 474 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YJR149WYJR149W 1215 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YBL036CYBL036C 774 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 RUF22RUF22 515 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 RFA2YNL312W 822 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YOR024WYOR024W 324 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 PBI1YPL272C 1554 nt8.31□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 MTF2YDL044C 1323 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 KAR5YMR065W 1515 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 MHR1YDR296W 681 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 PTI1YGR156W 1278 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 CLC1YGR167W 702 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 MRPS17YMR188C 714 nt8.3□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 DHH1YDL160C 1521 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 GIC2YDR309C 1152 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 NCS6YGL211W 1080 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 UPF3YGR072W 1164 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 PCT1YGR202C 1275 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 RPC25YKL144C 639 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 MHT1YLL062C 975 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 IRC25YLR021W 540 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 GMC2YLR445W 567 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 TOM7YNL070W 183 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YNL140CYNL140C 570 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 MDH2YOL126C 1134 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 ODC2YOR222W 924 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YDR132CYDR132C 1488 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 TAH18YPR048W 1872 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 ZAP1YJL056C 2643 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 ARO8YGL202W 1503 nt8.29□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 RRG1YDR065W 1098 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YPI1YFR003C 468 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 DAM1YGR113W 1032 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 IMP3YHR148W 552 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 RPB4YJL140W 666 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 NTR2YKR022C 969 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 GMH1YKR030W 822 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 TAD3YLR316C 969 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YLR402WYLR402W 192 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt8.28□□□□□ -1.08
TY1A-BRQ12217 COX2Q0250 756 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 GCV3YAL044C 513 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 HMX1YLR205C 954 nt8.27□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 TRS31YDR472W 852 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YER137CYER137C 447 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 HIS2YFR025C 1008 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YPT6YLR262C 648 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 DLT1YMR126C 1029 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 PIN2YOR104W 849 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YOR152CYOR152C 771 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 GRX5YPL059W 453 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 ATG32YIL146C 1590 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YKR023WYKR023W 1593 nt8.26□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 SWD1YAR003W 1281 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 KTR7YIL085C 1554 nt8.25□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 IRC22YEL001C 678 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 DSD1YGL196W 1287 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt8.24□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 NSE3YDR288W 912 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 ECM1YAL059W 639 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YLR046CYLR046C 813 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 RRT8YOL048C 1029 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YJR124CYJR124C 1347 nt8.23□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 CRP1YHR146W 1398 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 SHM2YLR058C 1410 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 PPH21YDL134C 1110 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YDR094WYDR094W 336 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 AIM36YMR157C 768 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 ECM18YDR125C 1362 nt8.22□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 YHR131CYHR131C 2553 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 SEC12YNR026C 1416 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 RSC8YFR037C 1674 nt8.21□□□□□ -1.09
TY1A-BRQ12217 HSP31YDR533C 714 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 ERG26YGL001C 1050 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 RSR1YGR152C 819 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 LNP1YHR192W 837 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 LAC1YKL008C 1257 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SPS4YOR313C 1017 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SUI3YPL237W 858 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 PWR1PWR1 941 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 ABD1YBR236C 1311 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.21□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 MAK11YKL021C 1407 nt8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.7 ms