Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AP3S2P59780 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AP3S2P59780 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3S2P59780 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms