Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 THR1YHR025W 1074 nt7.72□□□□□ -1.17
YBL028CP38202 YKL077WYKL077W 1179 nt7.72□□□□□ -1.17
YBL028CP38202 Q0010Q0010 387 nt7.72□□□□□ -1.17
YBL028CP38202 CTA1YDR256C 1548 nt7.72□□□□□ -1.17
YBL028CP38202 VBA5YKR105C 1749 nt7.72□□□□□ -1.17
YBL028CP38202 HPT1YDR399W 666 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 GNA1YFL017C 480 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 MED6YHR058C 888 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 PTC7YHR076W 1032 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 TDH2YJR009C 999 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 PHO85YPL031C 918 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 CMK2YOL016C 1344 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 DUS3YLR401C 2007 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 FRT1YOR324C 1809 nt7.71□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 MHT1YLL062C 975 nt7.7□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 RNH1YMR234W 1047 nt7.7□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YNL190WYNL190W 615 nt7.7□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YBR027CYBR027C 333 nt7.7□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 MSS51YLR203C 1311 nt7.7□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 GTS1YGL181W 1191 nt7.69□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 CUE4YML101C 354 nt7.69□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 SPG5YMR191W 1122 nt7.69□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 FSF1YOR271C 984 nt7.69□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 TAE1YBR261C 699 nt7.69□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 BEM1YBR200W 1656 nt7.68□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 CUP2YGL166W 678 nt7.68□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YJR154WYJR154W 1041 nt7.68□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YKR045CYKR045C 552 nt7.68□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 RNH201YNL072W 924 nt7.68□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 SEC62YPL094C 825 nt7.68□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.66□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 SWD1YAR003W 1281 nt7.66□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 GPD2YOL059W 1323 nt7.66□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 HEL1YKR017C 1656 nt7.66□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.65□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 MSP1YGR028W 1089 nt7.65□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.65□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 SMC5YOL034W 3282 nt7.65□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YOR041CYOR041C 432 nt7.65□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.65□□□□□ -1.18
YBL028CP38202 LAS17YOR181W 1902 nt7.64□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 VMA3YEL027W 483 nt7.64□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 YPR127WYPR127W 1038 nt7.64□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 PFS2YNL317W 1398 nt7.63□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 RPL31BYLR406C 342 nt7.63□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 DLD1YDL174C 1764 nt7.62□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 UIP5YKR044W 1332 nt7.62□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 FCP1YMR277W 2199 nt7.62□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 YMR295CYMR295C 594 nt7.62□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 COQ3YOL096C 939 nt7.62□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 MRPL23YOR150W 492 nt7.62□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 DOT1YDR440W 1749 nt7.61□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 MSG5YNL053W 1470 nt7.61□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 CDC23YHR166C 1881 nt7.6□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 MAL31YBR298C 1845 nt7.6□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 DAL7YIR031C 1665 nt7.6□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 ZWF1YNL241C 1518 nt7.59□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 HED1YDR014W-A 489 nt7.59□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.59□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 MRPL10YNL284C 969 nt7.59□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 EXG2YDR261C 1689 nt7.59□□□□□ -1.19
YBL028CP38202 HSV2YGR223C 1347 nt7.58□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 PRE3YJL001W 648 nt7.58□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.58□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 TMA46YOR091W 1038 nt7.58□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 FLC2YAL053W 2352 nt7.56□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 NUP57YGR119C 1626 nt7.56□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YRB2YIL063C 984 nt7.56□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 SCS7YMR272C 1155 nt7.56□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 UBP13YBL067C 2244 nt7.55□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 MPC2YHR162W 390 nt7.55□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 MIX17YMR002W 471 nt7.55□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YOR200WYOR200W 399 nt7.55□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YHK8YHR048W 1545 nt7.55□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 IRC5YFR038W 2562 nt7.55□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 PPH22YDL188C 1134 nt7.54□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 ZRT2YLR130C 1269 nt7.54□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YEN1YER041W 2280 nt7.54□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.53□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YAR064WYAR064W 300 nt7.53□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 ADH5YBR145W 1056 nt7.53□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 CTF3YLR381W 2202 nt7.53□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 CCT8YJL008C 1707 nt7.52□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 HXT9YJL219W 1704 nt7.52□□□□□ -1.2
YBL028CP38202 YCR061WYCR061W 1896 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 GGC1YDL198C 903 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 RPS28AYOR167C 204 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 SGF29YCL010C 780 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 AFG2YLR397C 2343 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 FCY2YER056C 1602 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 TDP1YBR223C 1635 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 YMR034CYMR034C 1305 nt7.52□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 CBR1YIL043C 855 nt7.51□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 DSF1YEL070W 1509 nt7.51□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 YNR073CYNR073C 1509 nt7.51□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 YIL108WYIL108W 2091 nt7.5□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 IRC7YFR055W 1023 nt7.5□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 MGM101YJR144W 810 nt7.5□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 CTF19YPL018W 1110 nt7.5□□□□□ -1.21
YBL028CP38202 YPL264CYPL264C 1062 nt7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.7 ms