Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 NCA3YJL116C 1014 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT5P38176 ERV2YPR037C 591 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT5P38176 FRE5YOR384W 2085 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT5P38176 SPS1YDR523C 1473 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT5P38176 PXL1YKR090W 2121 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT5P38176 SUN4YNL066W 1263 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT5P38176 YTH1YPR107C 627 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT5P38176 VHT1YGR065C 1782 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT5P38176 IMA5YJL216C 1746 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT5P38176 RSA4YCR072C 1548 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT5P38176 HAC1YFL031W 717 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT5P38176 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT5P38176 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT5P38176 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT5P38176 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT5P38176 TDP1YBR223C 1635 nt5.84□□□□□ -1.47
AVT5P38176 DYS1YHR068W 1164 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT5P38176 RIB1YBL033C 1038 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT5P38176 YOR300WYOR300W 309 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT5P38176 CIR2YOR356W 1896 nt5.83□□□□□ -1.48
AVT5P38176 SLX5YDL013W 1860 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 PPM1YDR435C 987 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 YDR476CYDR476C 675 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 SOD2YHR008C 702 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 YJL144WYJL144W 315 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 RMA1YKL132C 1293 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 ADE1YAR015W 921 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 ALT2YDR111C 1524 nt5.82□□□□□ -1.48
AVT5P38176 OSM1YJR051W 1506 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT5P38176 PPH22YDL188C 1134 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT5P38176 YHC3YJL059W 1227 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT5P38176 MHP1YJL042W 4197 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT5P38176 DAL7YIR031C 1665 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT5P38176 RGD1YBR260C 2001 nt5.81□□□□□ -1.48
AVT5P38176 KTR5YNL029C 1569 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT5P38176 PET494YNR045W 1470 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT5P38176 YPL277CYPL277C 1464 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT5P38176 ICS3YJL077C 396 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT5P38176 HRB1YNL004W 1365 nt5.8□□□□□ -1.48
AVT5P38176 ARG81YML099C 2643 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 CDC7YDL017W 1524 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 MAK32YCR019W 1092 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 SKP1YDR328C 585 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 YJL213WYJL213W 996 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 YJR142WYJR142W 1029 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 PHO85YPL031C 918 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 HAL5YJL165C 2568 nt5.79□□□□□ -1.48
AVT5P38176 KDX1YKL161C 1302 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT5P38176 PEX13YLR191W 1161 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT5P38176 CSC1YLR241W 2349 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT5P38176 TPO3YPR156C 1869 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT5P38176 ADH5YBR145W 1056 nt5.78□□□□□ -1.48
AVT5P38176 URH1YDR400W 1023 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT5P38176 PIL1YGR086C 1020 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT5P38176 MIX17YMR002W 471 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT5P38176 ARA2YMR041C 1008 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT5P38176 MSI1YBR195C 1269 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT5P38176 RMD9YGL107C 1941 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT5P38176 RDR1YOR380W 1641 nt5.77□□□□□ -1.49
AVT5P38176 CUE4YML101C 354 nt5.76□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YOL099CYOL099C 492 nt5.76□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YPR127WYPR127W 1038 nt5.76□□□□□ -1.49
AVT5P38176 PEX31YGR004W 1389 nt5.76□□□□□ -1.49
AVT5P38176 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.75□□□□□ -1.49
AVT5P38176 CCP1YKR066C 1086 nt5.75□□□□□ -1.49
AVT5P38176 CCW12YLR110C 402 nt5.75□□□□□ -1.49
AVT5P38176 PUS5YLR165C 765 nt5.75□□□□□ -1.49
AVT5P38176 REG2YBR050C 1017 nt5.75□□□□□ -1.49
AVT5P38176 CIT3YPR001W 1461 nt5.75□□□□□ -1.49
AVT5P38176 RGD2YFL047W 2145 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YGL081WYGL081W 963 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 NMA2YGR010W 1188 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YML6YML025C 861 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 FUS3YBL016W 1062 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YMR074CYMR074C 438 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 NAF1YNL124W 1479 nt5.74□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YEN1YER041W 2280 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YDR387CYDR387C 1668 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 SES1YDR023W 1389 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 LCP5YER127W 1074 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 ESC8YOL017W 2145 nt5.73□□□□□ -1.49
AVT5P38176 DLD1YDL174C 1764 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 CIT2YCR005C 1383 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 PET117YER058W 324 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YJR107WYJR107W 987 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 PAM17YKR065C 594 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 YLR122CYLR122C 378 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 RPL43AYPR043W 279 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 TUF1YOR187W 1314 nt5.72□□□□□ -1.49
AVT5P38176 SLA2YNL243W 2907 nt5.71□□□□□ -1.49
AVT5P38176 SDH8YBR269C 417 nt5.71□□□□□ -1.5
AVT5P38176 PGI1YBR196C 1665 nt5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.3 ms