Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 625.4 ms