Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms