Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRYD3Q8NCJ5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms