Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
HIF1AQ16665 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIF1AQ16665 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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