Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP25-1Q3LHN0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 421.6 ms