Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCSO14618 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCSO14618 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCSO14618 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCSO14618 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCSO14618 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CCSO14618 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCSO14618 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCSO14618 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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