Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL11Q9NVR0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL11Q9NVR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHL11Q9NVR0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms