Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCX3BQ9H321 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCX3BQ9H321 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCX3BQ9H321 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms