Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDEL1Q9GZM8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDEL1Q9GZM8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms