Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HIGD2AQ9BW72 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIGD2AQ9BW72 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD2AQ9BW72 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms