Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO39Q8N4B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO39Q8N4B4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FBXO39Q8N4B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO39Q8N4B4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms