Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.63■■■■□ 3.46
STRCQ7RTU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
STRCQ7RTU9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
STRCQ7RTU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRCQ7RTU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
STRCQ7RTU9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
STRCQ7RTU9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms