Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDPD3Q7L5L3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GDPD3Q7L5L3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GDPD3Q7L5L3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms