Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
R3HDM1Q15032 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
R3HDM1Q15032 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
R3HDM1Q15032 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
R3HDM1Q15032 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
R3HDM1Q15032 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
R3HDM1Q15032 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
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