Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YMR074CYMR074C 438 nt7.24□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 RPR1RPR1 369 nt7.24□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 RTC4YNL254C 1206 nt7.24□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 YPQ1YOL092W 927 nt7.24□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 LIP5YOR196C 1245 nt7.24□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.23□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 YBL111CYBL111C 2004 nt7.22□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 YPQ2YDR352W 954 nt7.22□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 MLS1YNL117W 1665 nt7.22□□□□□ -1.25
LDB17Q12342 PET117YER058W 324 nt7.21□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 MBF1YOR298C-A 456 nt7.21□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 NFS1YCL017C 1494 nt7.21□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 MHP1YJL042W 4197 nt7.2□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 FCY2YER056C 1602 nt7.2□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 SDH8YBR269C 417 nt7.2□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 CDC7YDL017W 1524 nt7.2□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 HXT13YEL069C 1695 nt7.19□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 PGI1YBR196C 1665 nt7.19□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 DMC1YER179W 1005 nt7.18□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.18□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 LOT6YLR011W 576 nt7.18□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 ERG27YLR100W 1044 nt7.18□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.18□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 DPM1YPR183W 804 nt7.18□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 FCP1YMR277W 2199 nt7.18□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 NAF1YNL124W 1479 nt7.17□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 CST26YBR042C 1194 nt7.17□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 LAT1YNL071W 1449 nt7.17□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 NUP57YGR119C 1626 nt7.16□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 DML1YMR211W 1428 nt7.16□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 CYS3YAL012W 1185 nt7.15□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 PRS4YBL068W 981 nt7.15□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 RFS1YBR052C 633 nt7.15□□□□□ -1.26
LDB17Q12342 NUP84YDL116W 2181 nt7.15□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 CDC13YDL220C 2775 nt7.14□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 SUN4YNL066W 1263 nt7.14□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 PHO85YPL031C 918 nt7.14□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 RPL43AYPR043W 279 nt7.14□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 PPS1YBR276C 2424 nt7.13□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 EXG2YDR261C 1689 nt7.13□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 TUB1YML085C 1344 nt7.13□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 PDA1YER178W 1263 nt7.13□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.13□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 TRR2YHR106W 1029 nt7.13□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 snR30snR30 606 nt7.13□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 MPE1YKL059C 1326 nt7.12□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 SMC5YOL034W 3282 nt7.12□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 MSB3YNL293W 1902 nt7.11□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YOR012WYOR012W 414 nt7.11□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 DAL7YIR031C 1665 nt7.1□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YCR041WYCR041W 333 nt7.1□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YOX1YML027W 1158 nt7.1□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 GET4YOR164C 939 nt7.1□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YPR130CYPR130C 408 nt7.1□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YPL247CYPL247C 1572 nt7.1□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 PLB2YMR006C 2121 nt7.1□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 SNF4YGL115W 969 nt7.09□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 NAS6YGR232W 687 nt7.09□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YLR112WYLR112W 420 nt7.09□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YCL049CYCL049C 939 nt7.09□□□□□ -1.27
LDB17Q12342 YPR127WYPR127W 1038 nt7.07□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 HOG1YLR113W 1308 nt7.06□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 CMK2YOL016C 1344 nt7.06□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 PAC10YGR078C 600 nt7.06□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 BRN1YBL097W 2265 nt7.06□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 YCR049CYCR049C 447 nt7.05□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 THR1YHR025W 1074 nt7.05□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 SRF1YDL133W 1314 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 CIA1YDR267C 993 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 YAL045CYAL045C 309 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 AIM2YAL049C 741 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 ZIM17YNL310C 525 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 HTZ1YOL012C 405 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 CTA1YDR256C 1548 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 APE4YHR113W 1473 nt7.04□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 YOR389WYOR389W 1875 nt7.03□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 YLR162WYLR162W 357 nt7.03□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 SML1YML058W 315 nt7.03□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 MSG5YNL053W 1470 nt7.03□□□□□ -1.28
LDB17Q12342 TDP1YBR223C 1635 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 HAL5YJL165C 2568 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 HPT1YDR399W 666 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 HHY1YEL059W 309 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 BIM1YER016W 1035 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 DPH5YLR172C 903 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 CIR2YOR356W 1896 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 YEN1YER041W 2280 nt7.02□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 AIM46YHR199C 933 nt7.01□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 YNR005CYNR005C 405 nt7.01□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 NTG2YOL043C 1143 nt7.01□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 MCP1YOR228C 909 nt7.01□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 SSC1YJR045C 1965 nt7□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 MIX17YMR002W 471 nt7□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 COS10YNR075W 1125 nt7□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 SEC23YPR181C 2307 nt7□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 EFM1YHL039W 1758 nt7□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 HEL1YKR017C 1656 nt7□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 TRR1YDR353W 960 nt6.99□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 DLD1YDL174C 1764 nt6.99□□□□□ -1.29
LDB17Q12342 IRC5YFR038W 2562 nt6.98□□□□□ -1.29
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