Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 CIT2YCR005C 1383 nt7.46□□□□□ -1.21
VPS54Q12071 HXT13YEL069C 1695 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 DML1YMR211W 1428 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 NAF1YNL124W 1479 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 MGM101YJR144W 810 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 MCP1YOR228C 909 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YPR130CYPR130C 408 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 RTC4YNL254C 1206 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 RDR1YOR380W 1641 nt7.44□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YDR327WYDR327W 327 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YPQ2YDR352W 954 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 PET117YER058W 324 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YGL260WYGL260W 231 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 CCR4YAL021C 2514 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 GNA1YFL017C 480 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YJL144WYJL144W 315 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YLR030WYLR030W 792 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 DPM1YPR183W 804 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 DMC1YER179W 1005 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YKL147CYKL147C 618 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 YLR162WYLR162W 357 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 TUB1YML085C 1344 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS54Q12071 MLS1YNL117W 1665 nt7.4□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 YMR074CYMR074C 438 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 LGE1YPL055C 999 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 SPE3YPR069C 882 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 MSB3YNL293W 1902 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 MPE1YKL059C 1326 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 YOR041CYOR041C 432 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 GET4YOR164C 939 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 YCL049CYCL049C 939 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 CDC7YDL017W 1524 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 SML1YML058W 315 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 PUS4YNL292W 1212 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 LIP5YOR196C 1245 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 PGI1YBR196C 1665 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 UBP13YBL067C 2244 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 PLB2YMR006C 2121 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 CIA1YDR267C 993 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 ERG27YLR100W 1044 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 MSS51YLR203C 1311 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 FCP1YMR277W 2199 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 MAL31YBR298C 1845 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS54Q12071 MPH3YJR160C 1809 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 CDC23YHR166C 1881 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 AAD14YNL331C 1131 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 BIO3YNR058W 1443 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 BRN1YBL097W 2265 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 YER137CYER137C 447 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 GTS1YGL181W 1191 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 LDB7YBL006C 543 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 ERG10YPL028W 1197 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 RPL43AYPR043W 279 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 PLB3YOL011W 2061 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 CDC13YDL220C 2775 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 HTZ1YOL012C 405 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 YOL046CYOL046C 675 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 BNA3YJL060W 1335 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 YCR049CYCR049C 447 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 FLC2YAL053W 2352 nt7.28□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 YKR018CYKR018C 2178 nt7.27□□□□□ -1.24
VPS54Q12071 YNR005CYNR005C 405 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 EXG2YDR261C 1689 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 YJL163CYJL163C 1668 nt7.27□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 APE4YHR113W 1473 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 YOR111WYOR111W 699 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 SMC5YOL034W 3282 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 NUP57YGR119C 1626 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 RMD8YFR048W 1989 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 CTA1YDR256C 1548 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 NTG2YOL043C 1143 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 FIT2YOR382W 462 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 PHO85YPL031C 918 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 FCY2YER056C 1602 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 HPT1YDR399W 666 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 THR1YHR025W 1074 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 YAL045CYAL045C 309 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 YOL099CYOL099C 492 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 YPR076WYPR076W 375 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 CAN1YEL063C 1773 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 PRB1YEL060C 1908 nt7.21□□□□□ -1.25
VPS54Q12071 AGX1YFL030W 1158 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 SUN4YNL066W 1263 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 CYS4YGR155W 1524 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 DAL7YIR031C 1665 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 YLL058WYLL058W 1728 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 SEC24YIL109C 2781 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 YIP4YGL198W 708 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 PPS1YBR276C 2424 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 TOD6YBL054W 1578 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 TRR1YDR353W 960 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 CMK2YOL016C 1344 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 EDC3YEL015W 1656 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 PPH21YDL134C 1110 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 HOC1YJR075W 1191 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 YPR127WYPR127W 1038 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS54Q12071 ENB1YOL158C 1821 nt7.17□□□□□ -1.26
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