Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	RRN10	YBL025W	438 nt		5.93	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	SDH8	YBR269C	417 nt		5.93	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	GPH1	YPR160W	2709 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	ERS1	YCR075C	783 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	RPL2B	YIL018W	765 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	DLD1	YDL174C	1764 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	GSH1	YJL101C	2037 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	THR1	YHR025W	1074 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	YJR142W	YJR142W	1029 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	HBN1	YCL026C-B	582 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	CIT2	YCR005C	1383 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	NUP53	YMR153W	1428 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	IRC5	YFR038W	2562 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	CRN1	YLR429W	1956 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	CCT3	YJL014W	1605 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YMR090W	Q04304	AGP2	YBR132C	1791 nt		5.9	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	MSG5	YNL053W	1470 nt		5.9	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	MRPL28	YDR462W	444 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	SMK1	YPR054W	1167 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	CEM1	YER061C	1329 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	YBR241C	YBR241C	1467 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	VTS1	YOR359W	1572 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	SMC5	YOL034W	3282 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	YAL045C	YAL045C	309 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	PAM17	YKR065C	594 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	SLG1	YOR008C	1137 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	OPI11	YPR044C	354 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	MSI1	YBR195C	1269 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	GDH1	YOR375C	1365 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	YGL081W	YGL081W	963 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	DPM1	YPR183W	804 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	HSM3	YBR272C	1443 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	HOG1	YLR113W	1308 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	YDR476C	YDR476C	675 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	NMA2	YGR010W	1188 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	RDN5-2	RDN5-2	119 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	RDN5-3	RDN5-3	119 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	RDN5-4	RDN5-4	119 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	RDN5-5	RDN5-5	119 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	PUP1	YOR157C	786 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	ARP3	YJR065C	1350 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	HPT1	YDR399W	666 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	DMC1	YER179W	1005 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	COX16	YJL003W	357 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	YNR014W	YNR014W	639 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	YOL099C	YOL099C	492 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	YLL066C	YLL066C	3618 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YMR090W	Q04304	CTA1	YDR256C	1548 nt		5.84	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	SLA2	YNL243W	2907 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	ADE1	YAR015W	921 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	PAC2	YER007W	1557 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	OPI8	YKR035C	642 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	SUR7	YML052W	909 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	RTC4	YNL254C	1206 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	TOS2	YGR221C	1869 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	ACO1	YLR304C	2337 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	TUF1	YOR187W	1314 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	PPH22	YDL188C	1134 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	MRP1	YDR347W	966 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	YPQ2	YDR352W	954 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	PUS7	YOR243C	2031 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	RSP5	YER125W	2430 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	PRP2	YNR011C	2631 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	YPL247C	YPL247C	1572 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	BDF2	YDL070W	1917 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	YCR049C	YCR049C	447 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	YML122C	YML122C	381 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	CTF8	YHR191C	402 nt		5.79	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	ERG12	YMR208W	1332 nt		5.78	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	MLS1	YNL117W	1665 nt		5.78	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	SKY1	YMR216C	2229 nt		5.78	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	ADE17	YMR120C	1779 nt		5.78	□□□□□ -1.48
YMR090W	Q04304	ECM38	YLR299W	1983 nt		5.77	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	CLN1	YMR199W	1641 nt		5.77	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	RGD2	YFL047W	2145 nt		5.77	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	NFS1	YCL017C	1494 nt		5.77	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	MPE1	YKL059C	1326 nt		5.76	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	ECM27	YJR106W	2178 nt		5.76	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	EMP65	YER140W	1671 nt		5.76	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	GRH1	YDR517W	1119 nt		5.76	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	HSP12	YFL014W	330 nt		5.76	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	YIP4	YGL198W	708 nt		5.76	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	GCN3	YKR026C	918 nt		5.76	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	TUB1	YML085C	1344 nt		5.75	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	SGE1	YPR198W	1632 nt		5.75	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	TRS31	YDR472W	852 nt		5.75	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	YFL013W-A	YFL013W-A	804 nt		5.75	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	RPL5	YPL131W	894 nt		5.75	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	NTE1	YML059C	5040 nt		5.74	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	HIS1	YER055C	894 nt		5.74	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	NCA3	YJL116C	1014 nt		5.74	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	PEX31	YGR004W	1389 nt		5.72	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	DOC1	YGL240W	753 nt		5.72	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	YJL144W	YJL144W	315 nt		5.72	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	CUE4	YML101C	354 nt		5.72	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	VBA5	YKR105C	1749 nt		5.71	□□□□□ -1.49
YMR090W	Q04304	YKR032W	YKR032W	315 nt		5.71	□□□□□ -1.5
YMR090W	Q04304	SKI2	YLR398C	3864 nt		5.71	□□□□□ -1.5
YMR090W	Q04304	FCY22	YER060W-A	1593 nt		5.71	□□□□□ -1.5
YMR090W	Q04304	YMR034C	YMR034C	1305 nt		5.71	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.4 ms