Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 CDC3YLR314C 1563 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 TCB1YOR086C 3561 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 PIH1YHR034C 1035 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 YHR145CYHR145C 357 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 PRY2YKR013W 990 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 TOP3YLR234W 1971 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 YKR018CYKR018C 2178 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 CHS5YLR330W 2016 nt7.56□□□□□ -1.2
SND1Q04007 HNM1YGL077C 1692 nt7.55□□□□□ -1.2
SND1Q04007 SKP1YDR328C 585 nt7.55□□□□□ -1.2
SND1Q04007 SNF7YLR025W 723 nt7.55□□□□□ -1.2
SND1Q04007 ATP23YNR020C 813 nt7.55□□□□□ -1.2
SND1Q04007 CHA1YCL064C 1083 nt7.54□□□□□ -1.2
SND1Q04007 PIL1YGR086C 1020 nt7.54□□□□□ -1.2
SND1Q04007 SPE4YLR146C 903 nt7.54□□□□□ -1.2
SND1Q04007 OPT1YJL212C 2400 nt7.54□□□□□ -1.2
SND1Q04007 TFC6YDR362C 2019 nt7.54□□□□□ -1.2
SND1Q04007 CMK2YOL016C 1344 nt7.53□□□□□ -1.2
SND1Q04007 TIF2YJL138C 1188 nt7.53□□□□□ -1.2
SND1Q04007 TIF1YKR059W 1188 nt7.53□□□□□ -1.2
SND1Q04007 CKI1YLR133W 1749 nt7.52□□□□□ -1.2
SND1Q04007 BDS1YOL164W 1941 nt7.52□□□□□ -1.2
SND1Q04007 PUP2YGR253C 783 nt7.52□□□□□ -1.21
SND1Q04007 YBL111CYBL111C 2004 nt7.52□□□□□ -1.21
SND1Q04007 YCR049CYCR049C 447 nt7.51□□□□□ -1.21
SND1Q04007 RPR1RPR1 369 nt7.51□□□□□ -1.21
SND1Q04007 HST2YPL015C 1074 nt7.51□□□□□ -1.21
SND1Q04007 RTC2YBR147W 891 nt7.51□□□□□ -1.21
SND1Q04007 GNA1YFL017C 480 nt7.5□□□□□ -1.21
SND1Q04007 YAH1YPL252C 519 nt7.5□□□□□ -1.21
SND1Q04007 SEC24YIL109C 2781 nt7.5□□□□□ -1.21
SND1Q04007 PAM17YKR065C 594 nt7.49□□□□□ -1.21
SND1Q04007 ADH6YMR318C 1083 nt7.49□□□□□ -1.21
SND1Q04007 HOG1YLR113W 1308 nt7.49□□□□□ -1.21
SND1Q04007 ENP1YBR247C 1452 nt7.49□□□□□ -1.21
SND1Q04007 MAL31YBR298C 1845 nt7.48□□□□□ -1.21
SND1Q04007 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.48□□□□□ -1.21
SND1Q04007 YJL213WYJL213W 996 nt7.48□□□□□ -1.21
SND1Q04007 DCR2YLR361C 1737 nt7.48□□□□□ -1.21
SND1Q04007 PTH2YBL057C 627 nt7.48□□□□□ -1.21
SND1Q04007 TPI1YDR050C 747 nt7.47□□□□□ -1.21
SND1Q04007 YML122CYML122C 381 nt7.47□□□□□ -1.21
SND1Q04007 ARA2YMR041C 1008 nt7.47□□□□□ -1.21
SND1Q04007 YOR041CYOR041C 432 nt7.47□□□□□ -1.21
SND1Q04007 SLD7YOR060C 774 nt7.47□□□□□ -1.21
SND1Q04007 ERG24YNL280C 1317 nt7.47□□□□□ -1.21
SND1Q04007 SPS22YCL048W 1392 nt7.46□□□□□ -1.21
SND1Q04007 CCW12YLR110C 402 nt7.46□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YHM2YMR241W 945 nt7.46□□□□□ -1.22
SND1Q04007 FLC2YAL053W 2352 nt7.46□□□□□ -1.22
SND1Q04007 PMA2YPL036W 2844 nt7.46□□□□□ -1.22
SND1Q04007 RGT2YDL138W 2292 nt7.45□□□□□ -1.22
SND1Q04007 CDC23YHR166C 1881 nt7.45□□□□□ -1.22
SND1Q04007 HEL1YKR017C 1656 nt7.45□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YDR327WYDR327W 327 nt7.45□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YGL260WYGL260W 231 nt7.45□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YPL067CYPL067C 597 nt7.45□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YPL247CYPL247C 1572 nt7.44□□□□□ -1.22
SND1Q04007 ERR3YMR323W 1314 nt7.44□□□□□ -1.22
SND1Q04007 ERR1YOR393W 1314 nt7.44□□□□□ -1.22
SND1Q04007 ERR2YPL281C 1314 nt7.44□□□□□ -1.22
SND1Q04007 LAT1YNL071W 1449 nt7.44□□□□□ -1.22
SND1Q04007 RMD8YFR048W 1989 nt7.43□□□□□ -1.22
SND1Q04007 TRR2YHR106W 1029 nt7.43□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YMR253CYMR253C 1245 nt7.43□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YPQ1YOL092W 927 nt7.43□□□□□ -1.22
SND1Q04007 UME1YPL139C 1383 nt7.43□□□□□ -1.22
SND1Q04007 CCR4YAL021C 2514 nt7.42□□□□□ -1.22
SND1Q04007 NSE5YML023C 1671 nt7.42□□□□□ -1.22
SND1Q04007 PRB1YEL060C 1908 nt7.42□□□□□ -1.22
SND1Q04007 ATG23YLR431C 1362 nt7.42□□□□□ -1.22
SND1Q04007 GPA1YHR005C 1419 nt7.42□□□□□ -1.22
SND1Q04007 DPB2YPR175W 2070 nt7.42□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 ATP10YLR393W 840 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YOX1YML027W 1158 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 PRS4YBL068W 981 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 CIT2YCR005C 1383 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 CMR1YDL156W 1569 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 ASN2YGR124W 1719 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 AGP2YBR132C 1791 nt7.41□□□□□ -1.22
SND1Q04007 NUP84YDL116W 2181 nt7.4□□□□□ -1.22
SND1Q04007 YPQ2YDR352W 954 nt7.4□□□□□ -1.22
SND1Q04007 DML1YMR211W 1428 nt7.4□□□□□ -1.22
SND1Q04007 AFG3YER017C 2286 nt7.4□□□□□ -1.23
SND1Q04007 ENB1YOL158C 1821 nt7.39□□□□□ -1.23
SND1Q04007 YFL052WYFL052W 1398 nt7.39□□□□□ -1.23
SND1Q04007 MSS51YLR203C 1311 nt7.39□□□□□ -1.23
SND1Q04007 HGH1YGR187C 1185 nt7.39□□□□□ -1.23
SND1Q04007 DRS1YLL008W 2259 nt7.39□□□□□ -1.23
SND1Q04007 GAA1YLR088W 1845 nt7.38□□□□□ -1.23
SND1Q04007 NDE1YMR145C 1683 nt7.38□□□□□ -1.23
SND1Q04007 TUB1YML085C 1344 nt7.38□□□□□ -1.23
SND1Q04007 AVO2YMR068W 1281 nt7.38□□□□□ -1.23
SND1Q04007 COS10YNR075W 1125 nt7.38□□□□□ -1.23
SND1Q04007 CST26YBR042C 1194 nt7.38□□□□□ -1.23
SND1Q04007 TOD6YBL054W 1578 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 PET117YER058W 324 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 GTS1YGL181W 1191 nt7.37□□□□□ -1.23
SND1Q04007 COX16YJL003W 357 nt7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms