Protein–RNA interactions for Protein: Q01844

EWSR1, RNA-binding protein EWS, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EWSR1Q01844 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 27.4
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EWSR1Q01844 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 512.61□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 27.4
EWSR1Q01844 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 58.3□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 27.4
EWSR1Q01844 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 36.92□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 27.4
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EWSR1Q01844 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.749e-8■■■■■ 27.3
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EWSR1Q01844 CTNNB1-206ENST00000431914 634 ntTSL 48.36□□□□□ -1.079e-8■■■■■ 27.3
EWSR1Q01844 CTNNB1-207ENST00000433400 596 ntTSL 44.42□□□□□ -1.79e-8■■■■■ 27.3
EWSR1Q01844 CTNNB1-205ENST00000426215 563 ntTSL 43.66□□□□□ -1.829e-8■■■■■ 27.3
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EWSR1Q01844 GATD1-210ENST00000529362 578 ntTSL 317.62■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 27.3
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EWSR1Q01844 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 27.2
EWSR1Q01844 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 38.61□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 27.2
EWSR1Q01844 BAIAP2-208ENST00000572073 782 ntTSL 312.02□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 27.2
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EWSR1Q01844 BAIAP2-226ENST00000576364 542 ntTSL 58.41□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 27.2
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EWSR1Q01844 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 45.52□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 27.2
EWSR1Q01844 BCOR-207ENST00000412952 288 ntTSL 510.2□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 27.2
EWSR1Q01844 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 27.2
EWSR1Q01844 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 27.2
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EWSR1Q01844 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 27.1
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EWSR1Q01844 SELENOO-202ENST00000492092 1626 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 37.89□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 27.1
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EWSR1Q01844 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 27.1
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EWSR1Q01844 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 27.1
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EWSR1Q01844 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 311.27□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 411.06□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 HOXB-AS1-202ENST00000502764 578 ntTSL 310.89□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 27.1
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EWSR1Q01844 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-13■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 HOXB-AS1-204ENST00000508688 414 ntTSL 39.63□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 29.16□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 48.97□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 27.4□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.03□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 ZFPM2-204ENST00000518180 596 ntTSL 42.92□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 PPP2R2D-206ENST00000517472 573 ntTSL 31.83□□□□□ -2.123e-7■■■■■ 27.1
EWSR1Q01844 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 27
EWSR1Q01844 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 27
EWSR1Q01844 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 01e-6■■■■■ 27
EWSR1Q01844 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 213.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 27
EWSR1Q01844 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 513.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 27
EWSR1Q01844 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 27
EWSR1Q01844 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 27
EWSR1Q01844 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.14□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 27
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