Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
NESP48681 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
NESP48681 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
NESP48681 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
NESP48681 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
NESP48681 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
NESP48681 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
NESP48681 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
NESP48681 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
NESP48681 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
NESP48681 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
NESP48681 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
NESP48681 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
NESP48681 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
NESP48681 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
NESP48681 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
NESP48681 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
NESP48681 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
NESP48681 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
NESP48681 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
NESP48681 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
NESP48681 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
NESP48681 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NESP48681 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NESP48681 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NESP48681 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
NESP48681 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
NESP48681 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
NESP48681 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
NESP48681 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
NESP48681 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
NESP48681 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
NESP48681 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
NESP48681 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
NESP48681 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NESP48681 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NESP48681 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
NESP48681 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
NESP48681 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
NESP48681 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
NESP48681 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
NESP48681 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
NESP48681 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NESP48681 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NESP48681 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
NESP48681 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
NESP48681 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
NESP48681 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
NESP48681 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
NESP48681 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
NESP48681 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
NESP48681 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
NESP48681 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
NESP48681 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
NESP48681 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
NESP48681 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NESP48681 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
NESP48681 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
NESP48681 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
NESP48681 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
NESP48681 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
NESP48681 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
NESP48681 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.25■■■■■ 4.67
NESP48681 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
NESP48681 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
NESP48681 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
NESP48681 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
NESP48681 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
NESP48681 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NESP48681 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
NESP48681 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
NESP48681 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NESP48681 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
NESP48681 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
NESP48681 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NESP48681 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC44.2■■■■■ 4.67
NESP48681 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
NESP48681 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
NESP48681 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
NESP48681 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.66
NESP48681 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NESP48681 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NESP48681 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NESP48681 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
NESP48681 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NESP48681 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
NESP48681 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NESP48681 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
NESP48681 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NESP48681 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NESP48681 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
NESP48681 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NESP48681 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
NESP48681 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
NESP48681 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
NESP48681 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
NESP48681 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
NESP48681 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
NESP48681 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
NESP48681 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.1 ms