Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TM4SF4P48230 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF4P48230 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF4P48230 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms