Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 PHO3YBR092C 1404 nt6.08□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YDR327WYDR327W 327 nt6.08□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YIP4YGL198W 708 nt6.08□□□□□ -1.44
AVT5P38176 AVT4YNL101W 2142 nt6.08□□□□□ -1.44
AVT5P38176 GSH1YJL101C 2037 nt6.08□□□□□ -1.44
AVT5P38176 ASN2YGR124W 1719 nt6.08□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YHR033WYHR033W 1272 nt6.07□□□□□ -1.44
AVT5P38176 CPR2YHR057C 618 nt6.07□□□□□ -1.44
AVT5P38176 ARO7YPR060C 771 nt6.07□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YLL058WYLL058W 1728 nt6.07□□□□□ -1.44
AVT5P38176 ARP3YJR065C 1350 nt6.06□□□□□ -1.44
AVT5P38176 HOG1YLR113W 1308 nt6.06□□□□□ -1.44
AVT5P38176 ERS1YCR075C 783 nt6.06□□□□□ -1.44
AVT5P38176 DST1YGL043W 930 nt6.06□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YKL147CYKL147C 618 nt6.06□□□□□ -1.44
AVT5P38176 SLG1YOR008C 1137 nt6.06□□□□□ -1.44
AVT5P38176 KNS1YLL019C 2214 nt6.06□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YGL260WYGL260W 231 nt6.05□□□□□ -1.44
AVT5P38176 ERV25YML012W 636 nt6.05□□□□□ -1.44
AVT5P38176 SUR7YML052W 909 nt6.05□□□□□ -1.44
AVT5P38176 SNT309YPR101W 528 nt6.05□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YKR023WYKR023W 1593 nt6.05□□□□□ -1.44
AVT5P38176 CAR2YLR438W 1275 nt6.04□□□□□ -1.44
AVT5P38176 HDA1YNL021W 2121 nt6.04□□□□□ -1.44
AVT5P38176 CEF1YMR213W 1773 nt6.03□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YOS9YDR057W 1629 nt6.03□□□□□ -1.44
AVT5P38176 YAH1YPL252C 519 nt6.02□□□□□ -1.45
AVT5P38176 GPH1YPR160W 2709 nt6.02□□□□□ -1.45
AVT5P38176 ERP2YAL007C 648 nt6.01□□□□□ -1.45
AVT5P38176 TAH11YJR046W 1815 nt6.01□□□□□ -1.45
AVT5P38176 UBP13YBL067C 2244 nt6□□□□□ -1.45
AVT5P38176 YBR284WYBR284W 2394 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 YIL055CYIL055C 1884 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 ATG22YCL038C 1587 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 YDR215CYDR215C 414 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 YIL168WYIL168W 384 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 DAL4YIR028W 1908 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 ISC1YER019W 1434 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 STE3YKL178C 1413 nt5.99□□□□□ -1.45
AVT5P38176 snR82snR82 268 nt5.98□□□□□ -1.45
AVT5P38176 TDH1YJL052W 999 nt5.98□□□□□ -1.45
AVT5P38176 YUR1YJL139C 1287 nt5.98□□□□□ -1.45
AVT5P38176 OPI8YKR035C 642 nt5.98□□□□□ -1.45
AVT5P38176 AMN1YBR158W 1650 nt5.98□□□□□ -1.45
AVT5P38176 CCT3YJL014W 1605 nt5.97□□□□□ -1.45
AVT5P38176 UTR5YEL035C 501 nt5.97□□□□□ -1.45
AVT5P38176 YPC1YBR183W 951 nt5.97□□□□□ -1.45
AVT5P38176 ADA2YDR448W 1305 nt5.97□□□□□ -1.45
AVT5P38176 POP1YNL221C 2628 nt5.96□□□□□ -1.45
AVT5P38176 IRC5YFR038W 2562 nt5.96□□□□□ -1.46
AVT5P38176 COG1YGL223C 1254 nt5.95□□□□□ -1.46
AVT5P38176 DAL80YKR034W 810 nt5.95□□□□□ -1.46
AVT5P38176 IDP3YNL009W 1263 nt5.95□□□□□ -1.46
AVT5P38176 INP54YOL065C 1155 nt5.95□□□□□ -1.46
AVT5P38176 YNL295WYNL295W 1575 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 RRP43YCR035C 1185 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 FAF1YIL019W 1041 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 COX16YJL003W 357 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 HBN1YCL026C-B 582 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 RAP1YNL216W 2484 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 LAG2YOL025W 1983 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 RIO1YOR119C 1455 nt5.94□□□□□ -1.46
AVT5P38176 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 GET2YER083C 858 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 YGR127WYGR127W 939 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 YIA6YIL006W 1122 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 CEM1YER061C 1329 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 SPR1YOR190W 1338 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 PSP2YML017W 1782 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 KEL1YHR158C 3495 nt5.93□□□□□ -1.46
AVT5P38176 BIM1YER016W 1035 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT5P38176 OPI1YHL020C 1215 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT5P38176 TAD2YJL035C 753 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT5P38176 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT5P38176 ERG24YNL280C 1317 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT5P38176 ACS1YAL054C 2142 nt5.92□□□□□ -1.46
AVT5P38176 EFT2YDR385W 2529 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT5P38176 EFT1YOR133W 2529 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT5P38176 AIM33YML087C 939 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT5P38176 CPT1YNL130C 1182 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT5P38176 SGV1YPR161C 1974 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT5P38176 GDH1YOR375C 1365 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT5P38176 ELP4YPL101W 1371 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT5P38176 PNS1YOR161C 1620 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT5P38176 MRPL28YDR462W 444 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT5P38176 YPT10YBR264C 600 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT5P38176 HXK2YGL253W 1461 nt5.9□□□□□ -1.47
AVT5P38176 CYC8YBR112C 2901 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT5P38176 YNR014WYNR014W 639 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT5P38176 BDS1YOL164W 1941 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT5P38176 RPL5YPL131W 894 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT5P38176 PSA1YDL055C 1086 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT5P38176 MRP1YDR347W 966 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT5P38176 STS1YIR011C 960 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT5P38176 CIS3YJL158C 684 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT5P38176 DSC3YOR223W 879 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT5P38176 NUP53YMR153W 1428 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT5P38176 GEF1YJR040W 2340 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT5P38176 BRN1YBL097W 2265 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT5P38176 THI4YGR144W 981 nt5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.7 ms