Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GLI2P10070 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
GLI2P10070 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
GLI2P10070 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
GLI2P10070 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GLI2P10070 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GLI2P10070 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GLI2P10070 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GLI2P10070 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
GLI2P10070 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
GLI2P10070 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
GLI2P10070 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
GLI2P10070 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
GLI2P10070 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GLI2P10070 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GLI2P10070 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
GLI2P10070 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GLI2P10070 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GLI2P10070 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GLI2P10070 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GLI2P10070 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
GLI2P10070 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
GLI2P10070 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GLI2P10070 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GLI2P10070 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GLI2P10070 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
GLI2P10070 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
GLI2P10070 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
GLI2P10070 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
GLI2P10070 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
GLI2P10070 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GLI2P10070 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GLI2P10070 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GLI2P10070 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GLI2P10070 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GLI2P10070 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GLI2P10070 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GLI2P10070 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GLI2P10070 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GLI2P10070 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GLI2P10070 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GLI2P10070 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GLI2P10070 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GLI2P10070 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GLI2P10070 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GLI2P10070 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GLI2P10070 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
GLI2P10070 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GLI2P10070 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GLI2P10070 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
GLI2P10070 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GLI2P10070 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
GLI2P10070 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
GLI2P10070 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GLI2P10070 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
GLI2P10070 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GLI2P10070 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GLI2P10070 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GLI2P10070 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GLI2P10070 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GLI2P10070 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GLI2P10070 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GLI2P10070 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GLI2P10070 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GLI2P10070 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GLI2P10070 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GLI2P10070 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GLI2P10070 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
GLI2P10070 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
GLI2P10070 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GLI2P10070 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GLI2P10070 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GLI2P10070 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GLI2P10070 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GLI2P10070 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GLI2P10070 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GLI2P10070 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GLI2P10070 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
GLI2P10070 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GLI2P10070 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
GLI2P10070 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
GLI2P10070 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GLI2P10070 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
GLI2P10070 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GLI2P10070 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GLI2P10070 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GLI2P10070 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GLI2P10070 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GLI2P10070 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
GLI2P10070 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GLI2P10070 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GLI2P10070 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
GLI2P10070 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
GLI2P10070 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GLI2P10070 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GLI2P10070 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
GLI2P10070 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GLI2P10070 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.08■■■■□ 3.85
GLI2P10070 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GLI2P10070 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms