Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL3O95236 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL3O95236 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL3O95236 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL3O95236 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL3O95236 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL3O95236 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOL3O95236 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL3O95236 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL3O95236 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL3O95236 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL3O95236 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL3O95236 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL3O95236 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOL3O95236 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL3O95236 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOL3O95236 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL3O95236 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL3O95236 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL3O95236 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL3O95236 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL3O95236 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL3O95236 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOL3O95236 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL3O95236 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL3O95236 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOL3O95236 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL3O95236 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL3O95236 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL3O95236 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL3O95236 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOL3O95236 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL3O95236 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL3O95236 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL3O95236 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL3O95236 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL3O95236 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL3O95236 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL3O95236 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL3O95236 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL3O95236 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL3O95236 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL3O95236 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL3O95236 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL3O95236 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL3O95236 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL3O95236 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL3O95236 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL3O95236 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL3O95236 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL3O95236 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL3O95236 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL3O95236 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL3O95236 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL3O95236 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL3O95236 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL3O95236 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL3O95236 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL3O95236 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL3O95236 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL3O95236 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL3O95236 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL3O95236 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL3O95236 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL3O95236 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL3O95236 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL3O95236 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL3O95236 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL3O95236 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL3O95236 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL3O95236 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL3O95236 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOL3O95236 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL3O95236 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL3O95236 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms