Protein–RNA interactions for Protein: O75592

MYCBP2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, humanhuman

Predictions only

Length 4,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2O75592 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MYCBP2O75592 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MYCBP2O75592 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MYCBP2O75592 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms