Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRP5O75197 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
LRP5O75197 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRP5O75197 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRP5O75197 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LRP5O75197 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP5O75197 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP5O75197 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP5O75197 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP5O75197 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LRP5O75197 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRP5O75197 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LRP5O75197 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRP5O75197 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRP5O75197 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LRP5O75197 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRP5O75197 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRP5O75197 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRP5O75197 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRP5O75197 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRP5O75197 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRP5O75197 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LRP5O75197 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LRP5O75197 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRP5O75197 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
LRP5O75197 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRP5O75197 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRP5O75197 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LRP5O75197 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRP5O75197 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRP5O75197 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRP5O75197 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LRP5O75197 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRP5O75197 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
LRP5O75197 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRP5O75197 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRP5O75197 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
LRP5O75197 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRP5O75197 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
LRP5O75197 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LRP5O75197 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
LRP5O75197 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
LRP5O75197 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LRP5O75197 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRP5O75197 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LRP5O75197 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP5O75197 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP5O75197 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP5O75197 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP5O75197 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP5O75197 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LRP5O75197 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRP5O75197 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRP5O75197 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LRP5O75197 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRP5O75197 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRP5O75197 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRP5O75197 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LRP5O75197 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRP5O75197 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LRP5O75197 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP5O75197 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP5O75197 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP5O75197 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP5O75197 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP5O75197 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP5O75197 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LRP5O75197 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRP5O75197 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRP5O75197 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRP5O75197 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LRP5O75197 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRP5O75197 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRP5O75197 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRP5O75197 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRP5O75197 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRP5O75197 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRP5O75197 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRP5O75197 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRP5O75197 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRP5O75197 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
LRP5O75197 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRP5O75197 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRP5O75197 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
LRP5O75197 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
LRP5O75197 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRP5O75197 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRP5O75197 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRP5O75197 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRP5O75197 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LRP5O75197 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRP5O75197 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRP5O75197 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRP5O75197 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRP5O75197 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRP5O75197 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRP5O75197 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRP5O75197 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRP5O75197 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRP5O75197 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms