Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC51.39■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC51.38■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC51.38■■■■■ 5.82
ABCC9O60706 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC51.37■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC51.36■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC51.34■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.34■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC51.33■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
ABCC9O60706 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC51.28■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC51.28■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC51.26■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC51.26■■■■■ 5.8
ABCC9O60706 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.24■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC51.24■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC51.24■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC51.23■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC51.21■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC51.2■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC51.19■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC51.19■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC51.19■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
ABCC9O60706 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC51.19■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.19■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC51.18■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC51.17■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC51.15■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC51.14■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.13■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
ABCC9O60706 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC51.1■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.1■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC51.09■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC51.09■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.08■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC51.08■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC51.07■■■■■ 5.77
ABCC9O60706 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC51.03■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.02■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC51.01■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC51.01■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
ABCC9O60706 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC50.97■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC50.97■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC50.96■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
ABCC9O60706 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC50.94■■■■■ 5.74
ABCC9O60706 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
ABCC9O60706 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC50.92■■■■■ 5.74
ABCC9O60706 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.92■■■■■ 5.74
ABCC9O60706 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC50.92■■■■■ 5.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms