Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRN3E7EW58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRN3E7EW58 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRN3E7EW58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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