Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
STRCP1A6NGW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
STRCP1A6NGW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STRCP1A6NGW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
STRCP1A6NGW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRCP1A6NGW2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms