Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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