Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HIF1AQ16665 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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