Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCSO14618 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCSO14618 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCSO14618 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCSO14618 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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